我们在安装R包的时候，如果不是本地安装的话，需要调用网络，而目前的服务器基本都是在国外，所以经常会出现网络不稳定的情况，这个时候我们就需要设置镜像源，目前基本都有国内的镜像，所以每次安装包的时候最好先设置一下镜像源。
安装的过程中，会提示安装依赖的包，基本都是无脑安装，但是安装前还是建议先设置一下镜像，CRAN的可以在RStudio直接设置，而BiocManager的话，建议先输入以下代码选择一个镜像。
options(repos = r, BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
# options(repos = r, BioC_mirror="https://mirrors.nju.edu.cn/bioconductor/") #南京镜像
或者下面的代码一次性设置两个
local({
r <- getOption("repos")
r["CRAN"] <- "http://mirror.lzu.edu.cn/CRAN" #兰州大学镜像
options(repos = r, BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
})
CRAN镜像源：
- China
-
地址 学校 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 清华大学 https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/ 北京外国语学院 https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/ 中国科学技术大学 https://mirror-hk.koddos.net/CRAN/ KoDDoS in Hong Kong https://mirrors.e-ducation.cn/CRAN/ Elite Education https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/ 兰州大学 https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/ 南京大学 https://mirrors.tongji.edu.cn/CRAN/ 同济大学 https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ 上海交通大学 https://mirrors.sustech.edu.cn/CRAN/ 南方科技大学
bioconductor镜像源
| City | URL |
|---|---|
| 清华大学 | http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/ |
| 南京大学 | https://mirrors.nju.edu.cn/bioconductor/ |
| 北京外国语学院 | https://mirrors.bfsu.edu.cn/bioconductor |