upset
统计多个基因列表交集并画韦恩图和Upset图
2021-09-05
欧阳松
有时候,我们从GEO数据库挖掘了好几组数据集的差异表达基因,我们需要统计这些基因列表的交集,一般可以用韦恩图和Upset图。而韦恩图一般适合小样本的交集,而多个样本的话可以用Upset图来表示。
比如,我们通过GEO2R工具,获得了差异基因列表的结果,假设有6个基因列表,我们可以把显著性差异表达基因提取处理,用excel制作一个genelist,表头是数据集,每列是基因,保存为list.csv,导 …
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