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两独立样本显著性检验思路

2021-08-20 欧阳松
方差齐性检验 […] 方差具有齐性 […] student-t检验 […] 双尾假设 […] 单尾假设(less或greater) […] 方差不具有齐性 […] 近似t检验(t) […] 双尾假设 […] 单尾假设(less或greater) […] … 阅读全文 →

如何只下载TCGA肿瘤或正常标本的count

2021-07-01 欧阳松
其实有很多教程指导怎么下载count,最简单当然还有xena,但是我们知道TCGA的肿瘤样本中包括了肿瘤了正常样本,而且有些样本还是重复的,所以需要去重,还需要把肿瘤和正常过滤,现在推荐一下我自己摸索的一个办法 使用的是GDCRNATools,这个包可以下载RNA、miRNA和lncRNA,数据也是count,有人说能不能下载FPKM或者TPM,其实count才是最原始的,自己找一个包转换成TPM … 阅读全文 →
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