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单基因的肿瘤细胞系表达怎么看?CCLE告诉你
2021-08-30
欧阳松
泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现,而肿瘤细胞系一般用CCLE数据库. 临床生信之家是一个很好的在线工具,目前上架了CCLE的功能,出的图见下,可以实现单基因在泛癌和单病种的可视化,但是这个网址什么都好,就是有次数限制,后面使用要加钱,而且价钱不菲,学生党望而却步。。。
会R语言,当然可以省掉这笔巨款,而且可以DIY,乐趣无穷
首先去CCLE官网下载数据,目前网页更新了,功能也多了 …
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