ℂCK8数据主要是统计OD450的吸收值，一般的数据形式如下，保存为csv格式 […] cck8 <- read.csv("~/Desktop/cck8.csv") ## 宽数据转换为长数据 library(reshape2) cck8_long<-melt(cck8, id.vars = c('Time'), … 阅读全文 →

其实有很多教程指导怎么下载count，最简单当然还有xena，但是我们知道TCGA的肿瘤样本中包括了肿瘤了正常样本，而且有些样本还是重复的，所以需要去重，还需要把肿瘤和正常过滤，现在推荐一下我自己摸索的一个办法 使用的是GDCRNATools，这个包可以下载RNA、miRNA和lncRNA，数据也是count，有人说能不能下载FPKM或者TPM，其实count才是最原始的，自己找一个包转换成TPM … 阅读全文 →